Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Opn1mwO35599 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn1mwO35599 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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