Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ptch2O35595 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ptch2O35595 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptch2O35595 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms