Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc27a2O35488 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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