Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Edil3O35474 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edil3O35474 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edil3O35474 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edil3O35474 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edil3O35474 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edil3O35474 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Edil3O35474 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms