Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1dO35473 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1dO35473 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1dO35473 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C1dO35473 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1dO35473 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1dO35473 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1dO35473 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1dO35473 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1dO35473 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1dO35473 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1dO35473 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C1dO35473 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C1dO35473 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1dO35473 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1dO35473 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1dO35473 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1dO35473 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1dO35473 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1dO35473 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C1dO35473 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1dO35473 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1dO35473 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1dO35473 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1dO35473 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1dO35473 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1dO35473 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1dO35473 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C1dO35473 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1dO35473 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1dO35473 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1dO35473 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1dO35473 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1dO35473 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1dO35473 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1dO35473 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1dO35473 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1dO35473 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1dO35473 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1dO35473 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1dO35473 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1dO35473 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1dO35473 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C1dO35473 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1dO35473 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1dO35473 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1dO35473 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1dO35473 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1dO35473 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1dO35473 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
C1dO35473 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1dO35473 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1dO35473 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1dO35473 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1dO35473 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1dO35473 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1dO35473 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1dO35473 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1dO35473 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1dO35473 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1dO35473 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1dO35473 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1dO35473 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1dO35473 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1dO35473 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1dO35473 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1dO35473 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1dO35473 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms