Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atf6bO35451 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms