Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xbp1O35426 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms