Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Kpna6O35345 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Kpna6O35345 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms