Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf5O35326 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms