Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh2d1bO35324 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh2d1bO35324 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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