Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd2O35245 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms