Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Nedd9O35177 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Nedd9O35177 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Nedd9O35177 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Nedd9O35177 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd9O35177 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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