Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx3O35160 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx3O35160 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms