Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps1O08983 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps1O08983 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps1O08983 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps1O08983 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps1O08983 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hps1O08983 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hps1O08983 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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