Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NumblO08919 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NumblO08919 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NumblO08919 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NumblO08919 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NumblO08919 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NumblO08919 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NumblO08919 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NumblO08919 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NumblO08919 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NumblO08919 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NumblO08919 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NumblO08919 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NumblO08919 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NumblO08919 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NumblO08919 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NumblO08919 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NumblO08919 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NumblO08919 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NumblO08919 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NumblO08919 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NumblO08919 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NumblO08919 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NumblO08919 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NumblO08919 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NumblO08919 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NumblO08919 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NumblO08919 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NumblO08919 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NumblO08919 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NumblO08919 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NumblO08919 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NumblO08919 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NumblO08919 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NumblO08919 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NumblO08919 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NumblO08919 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NumblO08919 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NumblO08919 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NumblO08919 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NumblO08919 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NumblO08919 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NumblO08919 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NumblO08919 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NumblO08919 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NumblO08919 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NumblO08919 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NumblO08919 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NumblO08919 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NumblO08919 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NumblO08919 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NumblO08919 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NumblO08919 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NumblO08919 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NumblO08919 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NumblO08919 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NumblO08919 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NumblO08919 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NumblO08919 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NumblO08919 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NumblO08919 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NumblO08919 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NumblO08919 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NumblO08919 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NumblO08919 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NumblO08919 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NumblO08919 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NumblO08919 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NumblO08919 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NumblO08919 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NumblO08919 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NumblO08919 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NumblO08919 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms