Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eftud2O08810 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eftud2O08810 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms