Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp35M0QWN7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms