Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm20939L7N243 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm20939L7N243 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms