Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5458L7N219 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5458L7N219 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5458L7N219 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5458L7N219 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5458L7N219 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5458L7N219 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5458L7N219 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5458L7N219 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5458L7N219 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5458L7N219 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5458L7N219 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5458L7N219 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5458L7N219 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm5458L7N219 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms