Protein–RNA interactions for Protein: K7N5P2

Gm3402, Predicted gene 3402, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3402K7N5P2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3402K7N5P2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3402K7N5P2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms