Protein–RNA interactions for Protein: J3QPW6

1700122O11Rik, MCG53587, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700122O11RikJ3QPW6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700122O11RikJ3QPW6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms