Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccer2J3QPU5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccer2J3QPU5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms