Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim18J3QNP2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim18J3QNP2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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