Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc180J3QNE4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc180J3QNE4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc180J3QNE4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms