Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lipo1J3QME6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms