Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20834J3QM72 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20834J3QM72 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms