Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pot1bH7BX60 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pot1bH7BX60 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pot1bH7BX60 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pot1bH7BX60 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pot1bH7BX60 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pot1bH7BX60 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pot1bH7BX60 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pot1bH7BX60 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pot1bH7BX60 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pot1bH7BX60 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pot1bH7BX60 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pot1bH7BX60 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pot1bH7BX60 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pot1bH7BX60 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms