Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm29394H3BIW7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm29394H3BIW7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms