Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arfip1G5E8V9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arfip1G5E8V9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms