Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zc3h12bG3X9I7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms