Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim55G3X8Y1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms