Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccl26F8VQM2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ccl26F8VQM2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ccl26F8VQM2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms