Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ercc6F8VPZ5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ercc6F8VPZ5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms