Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp9yF8VPU6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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