Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Farp1F8VPU2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Farp1F8VPU2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms