Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdh9F8VPK8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms