Protein–RNA interactions for Protein: F7BE40

Arl9, ADP-ribosylation factor-like 9 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl9F7BE40 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Arl9F7BE40 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms