Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Gm20538F6Z9R1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms