Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Igkv1-99F6XWB2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms