Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm5861F6VCN9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm5861F6VCN9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm5861F6VCN9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm5861F6VCN9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm5861F6VCN9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm5861F6VCN9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm5861F6VCN9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm5861F6VCN9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm5861F6VCN9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5861F6VCN9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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