Protein–RNA interactions for Protein: F6URP1

Gm6619, Predicted gene 6619, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6619F6URP1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm6619F6URP1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6619F6URP1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms