Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm17555F6U8B9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms