Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syngap1F6SEU4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syngap1F6SEU4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms