Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod3E9QA62 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms