Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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ApobE9Q414 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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ApobE9Q414 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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ApobE9Q414 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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ApobE9Q414 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
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ApobE9Q414 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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ApobE9Q414 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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ApobE9Q414 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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ApobE9Q414 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ApobE9Q414 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
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