Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Ccdc171E9Q1U1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Ccdc171E9Q1U1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Ccdc171E9Q1U1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
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Ccdc171E9Q1U1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Ccdc171E9Q1U1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Ccdc171E9Q1U1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Ccdc171E9Q1U1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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