Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Myo5cE9Q1F5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms