Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt78E9Q0F0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt78E9Q0F0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms