Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdr1E9Q0B4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdr1E9Q0B4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms