Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20425E9Q035 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20425E9Q035 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms